RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	CDH8	P55286	799 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAF5	Q15542	800 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	NLRP4	Q96MN2	994 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	TWNK	Q96RR1	684 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	COL1A2	P08123	1366 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36	3e-6	■■■■■ 137.9
TMEM39B-208	ENST00000487305	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305		E5RJQ4	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	KRT36	O76013	467 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	EGFR	P00533	1210 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PRDX6	P30041	224 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CLCN2	P51788	898 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	NDST1	P52848	882 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	AQP5	P55064	265 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PKDCC	Q504Y2	493 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	NDE1	Q9NXR1	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305		H3BRJ5	948 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	FZD9	O00144	591 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	GPR25	O00155	361 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ACADSB	P45954	432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SATB1	Q01826	763 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	RCN2	Q14257	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	STON2	Q8WXE9	905 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM161B	Q96MY7	647 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPATA33	Q96N06	139 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	RILP	Q96NA2	401 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	OPHN1	O60890	802 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	AVIL	O75366	819 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SERPINE1	P05121	402 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CYP2F1	P24903	491 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CRABP2	P29373	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	PSMC4	P43686	418 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	HK2	P52789	917 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	OSTN	P61366	133 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	HIC1	Q14526	733 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	GATA6	Q92908	595 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	WDR90	Q96KV7	1748 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305		A0A0A0MRY4	1105 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM39B-208	ENST00000487305	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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