RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 NUAK2Q9H093 628 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 STIM1Q13586 685 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 C10orf25Q5T742 122 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 VPS45Q9NRW7 570 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 MYMKA6NI61 221 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 CLCA1A8K7I4 914 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 INPPL1O15357 1258 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 CD63P08962 238 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 MYL4P12829 197 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-210ENST00000485459 PRF1P14222 555 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 TSHRP16473 764 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SCP2P22307 547 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 CNGA3Q16281 694 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 AWAT2Q6E213 333 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 PIGKQ92643 395 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX27Q96L92 541 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.89□□□□□ -1.63
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