RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R2P41236 205 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TKTL1P51854 596 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 BCAT1P54687 386 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CUL2Q13617 745 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CBWD6Q4V339 395 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZNB5 142 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SYT12Q8IV01 421 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 UCMAQ8WVF2 138 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TIGD1Q96MW7 591 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PATE3B3GLJ2 98 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ZBED1O96006 694 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 IRX4P78413 519 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CETN1Q12798 172 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 STARD3Q14849 445 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 DENND1CQ8IV53 801 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 FRMD1Q8N878 549 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 RNF139Q8WU17 664 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PRRT4C9JH25 899 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 GFRA2O00451 464 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 NDUFS2O75306 463 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 VDRP11473 427 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 LRMPQ12912 555 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 RAB41Q5JT25 222 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 DDI1Q8WTU0 396 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PLD4Q96BZ4 506 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ACOX2Q99424 681 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 GABRG3Q99928 467 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CFIP05156 583 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PTGER3P43115 390 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ARID5AQ03989 594 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PDE4CQ08493 712 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 DEFB119Q8N690 84 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CEP76Q8TAP6 659 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 RAD54BQ9Y620 910 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQF6 199 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 NPC1O15118 1278 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 KLKB1P03952 638 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CISD3P0C7P0 127 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 NDUFV2P19404 249 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 HOXD12P35452 270 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 MAPK8P45983 427 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ADIGQ0VDE8 80 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ISM2Q6H9L7 571 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SLC35C1Q96A29 364 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CEP63Q96MT8 703 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 NT5C1BQ96P26 610 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SETSIPP0DME0 302 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 FMO5P49326 533 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ZNF33AQ06730 810 aa21.09■□□□□ 0.97
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