RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478196.6

RPS27A-208, Transcript of ribosomal protein S27a, human

TSL 2

Gene RPS27A, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS27A-208	ENST00000478196	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	UROC1	Q96N76	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	ABCB11	O95342	1321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196		A0A1B0GTW7	788 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	ADCY6	O43306	1168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PFKFB2	O60825	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	DTNB	O60941	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CYBA	P13498	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CCL5	P13501	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	IFNAR1	P17181	557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	KIF5B	P33176	963 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CYP2C19	P33261	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CRHR1	P34998	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	HSD17B4	P51659	736 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	NEK4	P51957	841 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	AK2	P54819	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PROK1	P58294	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CXADR	P78310	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	KCTD2	Q14681	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	ME3	Q16798	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	USH1G	Q495M9	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	MED25	Q71SY5	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	MAF1	Q9H063	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PFAS	O15067	1338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	MEIS2	O14770	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	KCNAB3	O43448	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	EDIL3	O43854	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	TMEM127	O75204	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	F2	P00734	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	EDNRB	P24530	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	GNAQ	P50148	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	NPY5R	Q15761	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	UBXN4	Q92575	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS27A-208	ENST00000478196	PHKB	Q93100	1093 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms