RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NELL1	Q92832	810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HCN2	Q9UL51	889 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DMD	P11532	3685 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNG3	O60359	315 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFPT2	O94808	682 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO21	O94952	628 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	KAT7	O95251	611 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MME	P08473	750 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TYR	P14679	529 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DRD1	P21728	446 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF165	P49910	485 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCR3	P51677	355 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBXN1	Q04323	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAD2	Q05329	585 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTK2	Q05397	1052 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NR1H3	Q13133	447 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFRA2	O00451	464 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRAP2	O75791	330 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCAM1	P13591	858 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRNB2	P17787	502 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC6A4	P31645	630 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACADSB	P45954	432 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CXCL12	P48061	93 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FNTB	P49356	437 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	COG7	P83436	770 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNKP	Q96T60	521 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55

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