RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 CSPG5O95196 566 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXB3-207ENST00000472863 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 TMC7Q7Z402 723 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 RFX6Q8HWS3 928 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 FAM71BQ8TC56 605 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 CASP10Q92851 521 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXB3-207ENST00000472863 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 STK39Q9UEW8 545 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 PLXNA3P51805 1871 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXB3-207ENST00000472863 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
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HOXB3-207ENST00000472863 SHHQ15465 462 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXB3-207ENST00000472863 MAATS1Q7Z4T9 603 aa28.58■■■□□ 2.17
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HOXB3-207ENST00000472863 PCYOX1Q9UHG3 505 aa28.58■■■□□ 2.17
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HOXB3-207ENST00000472863 PTGIRP43119 386 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 ERVFC1P60507 584 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 GUCY2DQ02846 1103 aa28.57■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 CCNG2Q16589 344 aa28.57■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 RNF139Q8WU17 664 aa28.57■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 EPB41L5Q9HCM4 733 aa28.57■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 TCF25Q9BQ70 676 aa28.56■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 ZNF670Q9BS34 389 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.54■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 TBX18O95935 607 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 RARGP13631 454 aa28.54■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 RNF34Q969K3 372 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 NTAN1Q96AB6 310 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.54■■■□□ 2.16
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HOXB3-207ENST00000472863 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 LIASO43766 372 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 TUBBP07437 444 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 MYBL2P10244 700 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-207ENST00000472863 CLCN6P51797 869 aa28.53■■■□□ 2.16
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