RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	AIF1	P55008	147 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SCML4	Q8N228	414 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ADAM32	Q8TC27	787 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	EDEM1	Q92611	657 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC9A7	Q96T83	725 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	DDIT4	Q9NX09	232 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PATJ	Q8NI35	1801 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SCN5A	Q14524	2016 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TLDC2	A0PJX2	215 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNN4	O15554	427 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TTC4	O95801	387 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NR2C2	P49116	596 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	HTT	P42858	3142 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NR1D1	P20393	614 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	AMPD1	P23109	780 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	KYNU	Q16719	465 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	RNF139	Q8WU17	664 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		19	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CREB3	O43889	395 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	MAP3K6	O95382	1288 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CENPU	Q71F23	418 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	USP3	Q9Y6I4	520 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM23	A6NLE4	172 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SMAP	O00193	183 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	MAGEA4	P43358	317 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC5A3	P53794	718 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	XRCC4	Q13426	336 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TCTN1	Q2MV58	587 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF280D	Q6N043	979 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	RELL1	Q8IUW5	271 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PAK5	Q9P286	719 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	18.98	■□□□□ 0.63	6e-7	■■■■■ 95.6
GCFC2-208	ENST00000472230	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	RBL1	P28749	1068 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ADRA1B	P35368	520 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC11A1	P49279	550 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TLE2	Q04725	743 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	FAAP100	Q0VG06	881 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TRIM60	Q495X7	471 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CPT1B	Q92523	772 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	RNF34	Q969K3	372 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf72	Q96LT7	481 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	RASGRF2	O14827	1237 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CXCL10	P02778	98 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CAPN2	P17655	700 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	GBE1	Q04446	702 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TTC25	Q96NG3	672 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63

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