RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM155BO75949 473 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 GYS1P13807 737 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CXCR5P32302 372 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MCM2P49736 904 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 BFSP2Q13515 415 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DNASE1L3Q13609 305 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 EFR3AQ14156 821 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PCID2Q5JVF3 399 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZPA2 131 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 THAP4Q8WY91 577 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAR2Q96K12 515 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.391e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KAT6AQ92794 2004 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 HMX3A6NHT5 357 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 RAMP2O60895 175 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CER1O95813 267 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MATN1P21941 496 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ADD2P35612 726 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 GDF5P43026 501 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PNLIPRP1P54315 467 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP85Q6P2H3 762 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT4P19013 534 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DRD4P21917 467 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.395e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-205ENST00000462042 DIO1P49895 249 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CACNA2D1P54289 1103 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 INHBCP55103 352 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS6KA2Q15349 733 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD16Q32M84 506 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC22Q5TAA0 569 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N1X5 172 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGB4Q8WW32 186 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMP4Q99727 224 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP26Q9BV47 211 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS16Q9H269 839 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA2Q9UL42 364 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DAPP1Q9UN19 280 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A087X1B8 175 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 H0Y3Z8 333 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP6R2O75170 966 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ELFN1P0C7U0 828 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP1P28562 367 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ZXDAP98168 799 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PSG6Q00889 435 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CFHR3Q02985 330 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DEUP1Q05D60 604 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 LMAN2Q12907 356 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ACSM6Q6P461 480 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.35□□□□□ -1.39
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