RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454859.7

ECHDC1-210, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-210ENST00000454859 PMS2P54278 862 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ADCY2Q08462 1091 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 SEMA3BQ13214 749 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PLD1Q13393 1074 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.278e-6■■■■□ 22.7
ECHDC1-210ENST00000454859 PDK1Q15118 436 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 DCAF6Q58WW2 860 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PLD5Q8N7P1 536 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 AZIN2Q96A70 460 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 LRRC39Q96DD0 335 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CCDC114Q96M63 670 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PEBP4Q96S96 227 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CCDC77Q9BR77 488 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CALN1Q9BXU9 219 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 MARCH5Q9NX47 278 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 C5orf60A6NFR6 353 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 WASH4PA8MWX3 477 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 M0QYT0 321 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CLDN5O00501 218 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PSMD3O43242 534 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 GCATO75600 419 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 GJB6O95452 261 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 MYBL2P10244 700 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 BDNFP23560 247 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 IL4RP24394 825 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 HOXC13P31276 330 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 FDFT1P37268 417 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 SLC11A1P49279 550 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 GLUD2P49448 558 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PTPROQ16827 1216 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 AADACL2Q6P093 401 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 MCUQ8NE86 351 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 TET1Q8NFU7 2136 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 HSPH1Q92598 858 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ZNF558Q96NG5 402 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.272e-34■■■■■ 33
ECHDC1-210ENST00000454859 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 IL23AQ9NPF7 189 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 OPHN1O60890 802 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 BEST1O76090 585 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 SOD2P04179 222 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 FYNP06241 537 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 RBP3P10745 1247 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 MLNP12872 115 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 CYP2F1P24903 491 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 CCR1P32246 355 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 HSD17B3P37058 310 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 GRIK1P39086 918 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 PLTPP55058 493 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 HTRA3P83110 453 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 ATP11AP98196 1134 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 DSG1Q02413 1049 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 NR1H3Q13133 447 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 DPYSQ14117 519 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 DENND2CQ68D51 928 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 CCNJLQ8IV13 435 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-210ENST00000454859 RNF139Q8WU17 664 aa7.09□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms