RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SGK1O00141 431 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ACRP10323 421 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ITIH2P19823 946 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ARL4AP40617 200 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 NOMO1Q15155 1222 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 NPNTQ6UXI9 565 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PLD5Q8N7P1 536 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 NTAN1Q96AB6 310 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ZNF558Q96NG5 402 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PTPRSQ13332 1948 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 IVDP26440 423 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GPR15P49685 360 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 VPS41P49754 854 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TAC4Q86UU9 113 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 BBOF1Q8ND07 529 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 IL23AQ9NPF7 189 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MTRRQ9UBK8 725 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SCML2Q9UQR0 700 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SCAPQ12770 1279 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PSMD5Q16401 504 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RBP3P10745 1247 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GOT1P17174 413 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ADRA1BP35368 520 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ROR1Q01973 937 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CAV1Q03135 178 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ALS2CLQ60I27 953 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CARNS1A5YM72 827 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 H3BRJ5 948 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 VNN2O95498 520 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 LAG3P18627 525 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CXCR3P49682 368 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MTMR3Q13615 1198 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SCD5Q86SK9 330 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 STKLD1Q8NE28 680 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RNF139Q8WU17 664 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TMEM169Q96HH4 297 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PPFIA2O75334 1257 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 IGLV3-25P01717 112 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SOD2P04179 222 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ITGA8P53708 1063 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 P3H1Q32P28 736 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CFAP58Q5T655 872 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ALPK3Q96L96 1907 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 A0A1W2PQH9 124 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TP73O15350 636 aa22.14■■□□□ 1.13
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