RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CHST12Q9NRB3 414 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 TBX20Q9UMR3 447 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ACOT9Q9Y305 439 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 AP1G2O75843 785 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 AADATQ8N5Z0 425 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 PRMT3O60678 531 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.86□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 COMMD9Q9P000 198 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 GNASQ5JWF2 1037 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 LIN54Q6MZP7 749 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MZT2AQ6P582 158 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C1orf50Q9BV19 199 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 HS6ST1O60243 411 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GRIN3BO60391 1043 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HIST1H2ABP04908 130 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 RASA2Q15283 850 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PTGISQ16647 500 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 BRINP3Q76B58 766 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 VAV1P15498 845 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DSG3P32926 999 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 IL5RAQ01344 420 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 VAC14Q08AM6 782 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HLFQ16534 295 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GRTP1Q5TC63 336 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.85□□□□□ -1.31
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