RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 NUDT18Q6ZVK8 323 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 PHTF2Q8N3S3 785 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA1Q92805 767 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 HSFY1Q96LI6 401 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 NDST4Q9H3R1 872 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 MMP17Q9ULZ9 603 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 KCNJ18B7U540 433 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 RPP40O75818 363 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 TNFRSF4P43489 277 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 DGKEP52429 567 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 KCNJ12Q14500 433 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 TERB1Q8NA31 727 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 LAIR1Q6GTX8 287 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 IL17RCQ8NAC3 791 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF606Q8WXB4 792 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 PLD4Q96BZ4 506 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 MARK1Q9P0L2 795 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 GPR179Q6PRD1 2367 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 BECN2A8MW95 431 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 CACNG3O60359 315 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 LTFP02788 710 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 CHKAP35790 457 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 GPD2P43304 727 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 HARS2P49590 506 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 ANO7Q6IWH7 933 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 SCML4Q8N228 414 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 GAB3Q8WWW8 586 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 IRGQQ8WZA9 623 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 USP18Q9UMW8 372 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF292O60281 2723 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 A0A0A0MRY4 1105 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 SGK1O00141 431 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO21O94952 628 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 DGKGP49619 791 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 MIIPQ5JXC2 388 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 FAM149B1Q96BN6 582 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 TPSD1Q9BZJ3 242 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 SIX2Q9NPC8 291 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 INVSQ9Y283 1065 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 CYBBP04839 570 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 WASP42768 502 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 CRY1Q16526 586 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 EOGTQ5NDL2 527 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM92Q6UXU6 159 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 PASD1Q8IV76 773 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-210ENST00000440825 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 NCAM1P13591 858 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ACADSBP45954 432 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 SPEM2Q0P670 501 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 KBTBD6Q86V97 674 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 DDI1Q8WTU0 396 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 SHC3Q92529 594 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ERLEC1Q96DZ1 483 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TSPAN3O60637 253 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ALDH1A2O94788 518 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 FYB2Q5VWT5 728 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 P2RY11Q96G91 374 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CYTH4Q9UIA0 394 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PRRT4C9JH25 899 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 E5RJQ4 531 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 DCLK1O15075 740 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ADAM23O75077 832 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 RETP07949 1114 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PTK2Q05397 1052 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 EBF1Q9UH73 591 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 EML5Q05BV3 1969 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms