RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 DENND1CQ8IV53 801 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CACNG3O60359 315 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RETP07949 1114 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DAOAP59103 153 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ZNF276Q8N554 614 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ACOX2Q99424 681 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MARK1Q9P0L2 795 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 A0A0A0MRY4 1105 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PRRT4C9JH25 899 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 BCKDHBP21953 392 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DGKGP49619 791 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 COG7P83436 770 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CNGA2Q16280 664 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RASSF3Q86WH2 238 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 FRMD1Q8N878 549 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MLKLQ8NB16 471 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RLN3Q8WXF3 142 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MIS12Q9H081 205 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 NUMA1Q14980 2115 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 BECN2A8MW95 431 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GBP1P32455 592 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF4P43489 277 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PLK5Q496M5 336 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 FYB2Q5VWT5 728 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RNF139Q8WU17 664 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 HMGB4Q8WW32 186 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ST7Q9NRC1 585 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 EBF1Q9UH73 591 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RAD54BQ9Y620 910 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 THAP12O43422 761 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GDF9O60383 454 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN3O60637 253 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 EPN2O95208 641 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LTFP02788 710 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CISD3P0C7P0 127 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GNA15P30679 374 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 USP8P40818 1118 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GPD2P43304 727 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 STILQ15468 1287 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GEN1Q17RS7 908 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 EOGTQ5NDL2 527 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GBP6Q6ZN66 633 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PLD4Q96BZ4 506 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DCLK3Q9C098 648 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SIX2Q9NPC8 291 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LAMA1P25391 3075 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 FAM170AA1A519 330 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-209ENST00000439106 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PRAME-209ENST00000439106 HOXB2P14652 356 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-209ENST00000439106 PON1P27169 355 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms