RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 UROC1Q96N76 676 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CNGB3Q9NQW8 809 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ALOX15BO15296 676 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CREB3O43889 395 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CREB1P16220 341 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ARL4AP40617 200 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 MMP13P45452 471 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 BNIPLQ7Z465 357 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CYP4X1Q8N118 509 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 USP3Q9Y6I4 520 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN15O75808 1086 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SUSD3Q96L08 255 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FAM107BQ9H098 131 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF487B1APH4 448 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ARVCFO00192 962 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NDC80O14777 642 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 GNRH1P01148 92 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 LTFP02788 710 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 AMHP03971 560 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 OR4Q2P0C623 313 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CHN1P15882 459 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ARL4CP56559 192 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TTC25Q96NG3 672 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PKMYT1Q99640 499 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 EPN3Q9H201 632 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 DTLQ9NZJ0 730 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 DSEQ9UL01 958 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 E7EVH7 732 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FKTNO75072 461 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD2P08910 425 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 BBS9Q3SYG4 887 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 BHLHA9Q7RTU4 235 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 EOMESO95936 686 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 IVLP07476 585 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 OR1G1P47890 313 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 STAT4Q14765 748 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 RNF139Q8WU17 664 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC77Q9BR77 488 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 DDIT4Q9NX09 232 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 KBTBD13C9JR72 458 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 I6L893 689 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFAB1O14561 156 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TCEA3O75764 348 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PIAS1O75925 651 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 MAP2K2P36507 400 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CCT5P48643 541 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CLUHO75153 1309 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 AVILO75366 819 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SSTR1P30872 391 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 GPX6P59796 221 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TSPY1Q01534 308 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ11Q14654 390 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PDIK1LQ8N165 341 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 RTP4Q96DX8 246 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PAK5Q9P286 719 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FAM72CH0Y354 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 INPPL1O15357 1258 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD11O43934 449 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 EFHC2Q5JST6 749 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms