RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ROBO3Q96MS0 1386 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC53A6NM62 1247 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BQF6 201 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3R2O00459 728 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM13O60858 407 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP9AO75110 1047 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMA3DO95025 777 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CXCL14O95715 111 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA4LO95757 839 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SNHG28P0DPA3 235 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SMPD1P17405 629 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TAC1P20366 129 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 STARD3Q14849 445 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIP10Q15642 601 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANO4Q32M45 955 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DCAF6Q58WW2 860 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf88Q6PI97 169 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MCUQ8NE86 351 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMC2Q8TDI7 906 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR20Q99678 358 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CNPY3Q9BT09 278 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 STK33Q9BYT3 514 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0G2JPF8 293 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANO9A1A5B4 782 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EML1O00423 815 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXP2O15409 715 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LGR5O75473 907 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMD10O75832 226 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CLPTM1O96005 669 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 VDRP11473 427 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CKBP12277 381 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP1A3P13637 1013 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2H1P32780 548 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT20P35900 424 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BCAP31P51572 246 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CDH6P55285 790 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PTK7Q13308 1070 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ACOT1Q86TX2 421 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 P3H2Q8IVL5 708 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 VSTM4Q8IW00 320 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NCLNQ969V3 563 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RMDN1Q96DB5 314 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGED4Q96JG8 741 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC18Q9H819 358 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HMG20AQ9NP66 347 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADA2Q9NZK5 511 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 COPG2Q9UBF2 871 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB23Q9ULC3 237 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 Q9Y3F1 56 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM150BA6NC51 233 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EVPLLA8MZ36 301 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AP3B1O00203 1094 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 COPEO14579 308 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PAMP19021 973 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BCAT1P54687 386 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB25P57735 213 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EVX2Q03828 476 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RRM2BQ7LG56 351 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PRUNE1Q86TP1 453 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C19orf18Q8NEA5 215 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 UBA3Q8TBC4 463 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ENKURQ8TC29 256 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms