RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS45Q9NRW7 570 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGL1Q9NZL6 768 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP83Q9Y592 693 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 E5RJQ4 531 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PODXLO00592 558 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 VIPP01282 170 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP13P45452 471 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1A4Q13733 1029 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNJ12Q14500 433 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC23BQ15437 767 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETFDHQ16134 617 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF398Q8TD17 642 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP4K1Q92918 833 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUL5Q93034 780 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF566Q969W8 418 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KAZALD1Q96I82 304 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNIP3Q96KP6 325 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2W5A6NFC9 320 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCHO1O14526 889 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TP73O15350 636 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLIN1O60240 522 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MATN1P21941 496 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TACR3P29371 465 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSTM5P46439 218 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GHRHRQ02643 423 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q4G0T1 1027 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANO7Q6IWH7 933 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRLQ86TD4 932 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1191Q96A73 305 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYD88Q99836 296 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDF15Q99988 308 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUAK2Q9H093 628 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS16Q9H269 839 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS4AQ9UN37 437 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP1P28562 367 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA7P48741 367 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 YPEL5P62699 121 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA3BQ13214 749 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNGA3Q16281 694 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPEG1Q2M385 716 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 P3H1Q32P28 736 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF425Q6IV72 752 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC30AQ86WT1 665 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEPTORQ8TB45 409 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGCZQ96LD1 299 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA14Q9ULX7 337 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC34A8MYJ7 566 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3KTA2 159 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM10O14672 748 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 INPPL1O15357 1258 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOSPD3O75425 235 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms