RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PMF1Q6P1K2 205 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SIKE1Q9BRV8 207 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 UGT1A7Q9HAW7 530 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 UGT1A10Q9HAW8 530 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 UGT1A8Q9HAW9 530 aa23.34■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 BMPR2Q13873 1038 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 STEAP4Q687X5 459 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TTC30AQ86WT1 665 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TREML1Q86YW5 311 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NRG4Q8WWG1 115 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.34■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ARMCX1Q9P291 453 aa23.34■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 METTL18O95568 372 aa23.33■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.33■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.33■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN9O14815 690 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TBX10O75333 385 aa23.32■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 KLC1Q07866 573 aa23.32■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 B2RBV5 119 aa23.31■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 MLNP12872 115 aa23.31■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 GRIK3Q13003 919 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.31■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC106Q9BWC9 280 aa23.31■■□□□ 1.32
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HOXD1-201ENST00000331462 CYB561D2O14569 222 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 GABBR2O75899 941 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 GBE1Q04446 702 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MPP5Q8N3R9 675 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf21Q9H246 121 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 THAP1Q9NVV9 213 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TM7SF2O76062 418 aa23.3■■□□□ 1.32
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