RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 APOL2Q9BQE5 337 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ZNF302Q9NR11 478 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 V9GYQ6 96 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 HDAC4P56524 1084 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TAP1Q03518 808 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 KRT72Q14CN4 511 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SNX32Q86XE0 403 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 OCEL1Q9H607 264 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 THEGQ9P2T0 379 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 AURKCQ9UQB9 309 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 USP12O75317 370 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 APBA3O96018 575 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.8■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 MAGEC1O60732 1142 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SPAG6O75602 509 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 APOEP02649 317 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 APOC2P02655 101 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ACTR2P61160 394 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PPM1JQ5JR12 505 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ZBBXA8MT70 800 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TPP1O14773 563 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 GIPC1O14908 333 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ICAM1P05362 532 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 MLH1P40692 756 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PDK1Q15118 436 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PGM5Q15124 567 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CATSPER2Q96P56 530 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 FZD1Q9UP38 647 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ITM2AO43736 263 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TMCC1O94876 653 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 WNT7BP56706 349 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SEPT6Q14141 434 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ASB3Q9Y575 518 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PTPRJQ12913 1337 aa15.79■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SERPINA6P08185 405 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 POU5F1BQ06416 359 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 BBS12Q6ZW61 710 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ACAD11Q709F0 780 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PID1Q7Z2X4 250 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TFAP2BQ92481 460 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ATG4CQ96DT6 458 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CSH1P0DML2 217 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CSH2P0DML3 217 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 AVPR1AP37288 418 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 GATA6Q92908 595 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CDH22Q9UJ99 828 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 SIN3BO75182 1162 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ARL4AP40617 200 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 PRPSAP1Q14558 356 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.78■□□□□ 0.12
USP25-201ENST00000285679 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms