RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPR142Q7Z601 462 aa20.02■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.02■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GBP5Q96PP8 586 aa20.02■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.02■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 STOML1Q9UBI4 398 aa20.02■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SPAG6O75602 509 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 THP07101 528 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CD101Q93033 1021 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NSL1Q96IY1 281 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ALOX15BO15296 676 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRAMEP78395 509 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CYP1B1Q16678 543 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RASIP1Q5U651 963 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SP110Q9HB58 689 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AIM2O14862 343 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EDN1P05305 212 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CA9Q16790 459 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNPY4Q8N129 248 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PTPRN2Q92932 1015 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SYT15Q9BQS2 421 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PSMB4P28070 264 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CPT1AP50416 773 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHADLQ6NUI6 762 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRPA1O75762 1119 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UPP2O95045 317 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MT-CO1P00395 513 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LMO2P25791 158 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POU6F1Q14863 301 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RABGAP1LQ5R372 815 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 STRA8Q7Z7C7 330 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BTBD19C9JJ37 291 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BDNFP23560 247 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FITM2Q8N6M3 262 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 VCX3BQ9H321 246 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMEM63AO94886 807 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KRT16P08779 473 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SKIP12755 728 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TAC1P20366 129 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PNPLA4P41247 253 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SCNN1GP51170 649 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OCRLQ01968 901 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RASA2Q15283 850 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 VSTM1Q6UX27 236 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 STRNO43815 780 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ILDR2Q71H61 639 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SDCBP2Q9H190 292 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRDM12Q9H4Q4 367 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TREHO43280 583 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PCSK1P29120 753 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ITGA9Q13797 1035 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MFSD14CQ5VZR4 134 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM117BQ6P1L5 589 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GSDMBQ8TAX9 411 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AGAP11Q8TF27 550 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MEI4A8MW99 385 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RCN1Q15293 331 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAB6CQ53S08 254 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SENP8Q96LD8 212 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAB6CQ9H0N0 254 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATP8B3O60423 1300 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPAN1O60635 241 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXN2P32314 431 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDC42EP1Q00587 391 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OTOAQ7RTW8 1153 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms