RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 TGDSO95455 350 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ASGR1P07306 291 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 GSTA2P09210 222 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 MMP8P22894 467 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CDKN2BP42772 138 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 AP1B1Q10567 949 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 KYAT1Q16773 422 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 MSS51Q4VC12 460 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 HPDLQ96IR7 371 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 SPC25Q9HBM1 224 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CITO14578 2027 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 MAP3K7O43318 606 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CALB1P05937 261 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 HTRA3P83110 453 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 KCNA10Q16322 511 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CHSY1Q86X52 802 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CPT1BQ92523 772 aa20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PPEF2O14830 753 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TBX10O75333 385 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CTSHP09668 335 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TWNKQ96RR1 684 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 KCNK13Q9HB14 408 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 RECQL4O94761 1208 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 BBS9Q3SYG4 887 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 RNF220Q5VTB9 566 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 BCO2Q9BYV7 579 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.93■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TTC17Q96AE7 1141 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PIDD1Q9HB75 910 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 KLHL33A6NCF5 533 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 A8MXQ7 604 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 DYNLT1P63172 113 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 UBXN11Q5T124 520 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 NME8Q8N427 588 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 APOPT1Q96IL0 206 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 SNX27Q96L92 541 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 E7ESA3 106 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 FCHO1O14526 889 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 KPNA6O60684 536 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CD19P15391 556 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PGM1P36871 562 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 PDIK1LQ8N165 341 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CYTH2Q99418 400 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.92■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TSHRP16473 764 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 BGNP21810 368 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 RAB27AP51159 221 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CACNA2D1P54289 1103 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 OGDHQ02218 1023 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ACTL9Q8TC94 416 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 IFT43Q96FT9 208 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 CREBZFQ9NS37 354 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 MYL2P10916 166 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 NEK3P51956 506 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 GDF10P55107 478 aa20.91■□□□□ 0.94
VGF-201ENST00000249330 RBP5P82980 135 aa20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms