RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 SNTNA6NMZ2 147 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DNAJC6O75061 913 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 LCP1P13796 627 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ACADSP16219 412 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SERPINB3P29508 390 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DDIT4Q9NX09 232 aa6.52□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 BIRC5O15392 142 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZMYND10O75800 440 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MATKP42679 507 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 EPHB3P54753 998 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CCDC78A2IDD5 438 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CHN1P15882 459 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ITGB6P18564 788 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TMEM237Q96Q45 408 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ASTN1O14525 1302 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TMEM114B3SHH9 223 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 M0R2N6 131 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DFFAO00273 331 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ADORA2BP29275 332 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CASP4P49662 377 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PEX5P50542 639 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 35.7
SETX-201ENST00000224140 SPACA6W5XKT8 324 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GSTA4O15217 222 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RIPK2O43353 540 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TGDSO95455 350 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PGAM1P18669 254 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MFSD5Q6N075 450 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RBBP8Q99708 897 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CACNA1SQ13698 1873 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ATP4AP20648 1035 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KLC1Q07866 573 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PRKAA1Q13131 559 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RCN2Q14257 317 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 WNT8BQ93098 351 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OR6C75A6NL08 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 AMHP03971 560 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MMP8P22894 467 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HMOX2P30519 316 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 INPP1P49441 399 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PDCLQ13371 301 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CRY1Q16526 586 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 REPS1Q96D71 796 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 COX16Q9P0S2 106 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MAFFQ9ULX9 164 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 A0A0G2JND7 137 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TTKP33981 857 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PSEN2P49810 448 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GHRHRQ02643 423 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MPP3Q13368 585 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MFSD10Q14728 455 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 IL31Q6EBC2 164 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GLTPD2A6NH11 291 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LIG3P49916 1009 aa6.52□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SULT2A1Q06520 285 aa6.52□□□□□ -1.37
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