RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA24	Q86W54	205 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	OCEL1	Q9H607	264 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	GPAM	Q9HCL2	828 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	KRT82	Q9NSB4	513 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SEPT4	O43236	478 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CFH	P08603	1231 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	IDO1	P14902	403 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	VAV1	P15498	845 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	MESD	Q14696	234 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TRABD2A	Q86V40	505 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	BCO2	Q9BYV7	579 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SNTG2	Q9NY99	539 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	DERA	Q9Y315	318 aa		15.92	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	RARB	P10826	455 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	NKX3-2	P78367	333 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	RBP5	P82980	135 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	KRT17	Q04695	432 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	GRM2	Q14416	872 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	LIN9	Q5TKA1	542 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PASD1	Q8IV76	773 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	MAML1	Q92585	1016 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	KIF12	Q96FN5	646 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CAPNS2	Q96L46	248 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	DPP3	Q9NY33	737 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CIT	O14578	2027 aa		15.91	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TOMM70	O94826	608 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PGK1	P00558	417 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	P4HA1	P13674	534 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SP3	Q02447	781 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM32	Q13049	653 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF394	Q53GI3	561 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	MON1B	Q7L1V2	547 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	HAUS1	Q96CS2	278 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	NDE1	Q9NXR1	346 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	FKBP6	O75344	327 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CIB2	O75838	187 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ATF2	P15336	505 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	COMT	P21964	271 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	RRM1	P23921	792 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	HPCA	P84074	193 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	HPDL	Q96IR7	371 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SNX27	Q96L92	541 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SDCBP2	Q9H190	292 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	BIRC5	O15392	142 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	RAP1GAP	P47736	663 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINB8	P50452	374 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	CDH8	P55286	799 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	CYP4X1	Q8N118	509 aa		15.89	■□□□□ 0.13
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD6	Q96KE9	485 aa		15.89	■□□□□ 0.13

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