RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A5P35504 534 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PRAMEP78395 509 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CETN1Q12798 172 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CAMK2BQ13554 666 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BMPR2Q13873 1038 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 HPS1Q92902 700 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 VPS50Q96JG6 964 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LRGUKQ96M69 825 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 VPS11Q9H270 941 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SENP1Q9P0U3 644 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPW3 197 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DENND3A2RUS2 1198 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UNCXA6NJT0 531 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 K7ENM7 598 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CFLARO15519 480 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FDX1P10109 184 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GAP43P17677 238 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CAV1Q03135 178 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 WDR78Q5VTH9 848 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AAGABQ6PD74 315 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 IL31RAQ8NI17 732 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DCAF4Q8WV16 495 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BTAF1O14981 1849 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CSPG5O95196 566 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PKNOX1P55347 436 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DYNLT1P63172 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LMNB2Q03252 620 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PERM1Q5SV97 790 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LENG9Q96B70 501 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PLOD2O00469 737 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AP1G1O43747 822 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TOM1L1O75674 476 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ATE1O95260 518 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 P4HA1P13674 534 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TCF4P15884 667 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CYP3A7P24462 503 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SREBF1P36956 1147 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R40P59535 323 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PTK7Q13308 1070 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 APOFQ13790 326 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KCNJ8Q15842 424 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LILRA2Q8N149 483 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BTBD9Q96Q07 612 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EHD1Q9H4M9 534 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 Q9H521 79 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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