RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PEX6	Q13608	980 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PMPCB	O75439	489 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	HMBS	P08397	361 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	GOT1	P17174	413 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINB5	P36952	375 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PPEF2	O14830	753 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	LGALS2	P05162	132 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	BNIP1	Q12981	228 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	OLIG2	Q13516	323 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ASB14	A6NK59	587 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	MSC	O60682	206 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGAV	P06756	1048 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	IVD	P26440	423 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PTPN4	P29074	926 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	JCHAIN	P01591	159 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNA3	P22001	575 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ADORA2A	P29274	412 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	GPX6	P59796	221 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ART3	Q13508	389 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR20	Q99678	358 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	GGA2	Q9UJY4	613 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	RECQL4	O94761	1208 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	HIC1	Q14526	733 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIP10	Q15642	601 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	MARK4	Q96L34	752 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
ACSS3-208	ENST00000616449	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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