RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SKA1Q96BD8 255 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM66O15016 1216 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TATDN2Q93075 761 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 EME1Q96AY2 570 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 RMND5AQ9H871 391 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB39O15060 712 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 KRT78Q8N1N4 520 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM199Q8N511 208 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 FAM136AQ96C01 138 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TSC22D3Q99576 134 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 THTPAQ9BU02 230 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SP3Q02447 781 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 ERP27Q96DN0 273 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 PCNAP12004 261 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 MICAL2O94851 1124 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 GALNTL6Q49A17 601 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 CYGBQ8WWM9 190 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TUBP50607 506 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 MYO1CO00159 1063 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 IMPDH2P12268 514 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 RAD18Q9NS91 495 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 ITGA9Q13797 1035 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 FIGNQ5HY92 759 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 OLFM3Q96PB7 478 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 ZIM3Q96PE6 472 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SPG21Q9NZD8 308 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 PXDNQ92626 1479 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SPTLC1O15269 473 aa20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 B2RBV5 119 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZW10O43264 779 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 IGSF6O95976 241 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 LGI2Q8N0V4 545 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 DCLK3Q9C098 648 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 UBP1Q9NZI7 540 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NRCAMQ92823 1304 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 WHRNQ9P202 907 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 HPSEQ9Y251 543 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 RBP1P09455 135 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NFIL3Q16649 462 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO10Q9UK96 956 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN8O00124 270 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 FKTNO75072 461 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 HPGDP15428 266 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 STX5Q13190 355 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF614Q8N883 585 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 GPAMQ9HCL2 828 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MGAT4DA6NG13 374 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms