RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607092.1

CUX1-220, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 3

Gene CUX1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-220ENST00000607092 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CUX1-220ENST00000607092 IQUBQ8NA54 791 aa6.65□□□□□ -1.34
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CUX1-220ENST00000607092 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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CUX1-220ENST00000607092 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX1-220ENST00000607092 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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CUX1-220ENST00000607092 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.65□□□□□ -1.34
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CUX1-220ENST00000607092 GRIK2Q13002 908 aa6.63□□□□□ -1.35
CUX1-220ENST00000607092 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CUX1-220ENST00000607092 NCOA4Q13772 614 aa6.63□□□□□ -1.35
CUX1-220ENST00000607092 STK38Q15208 465 aa6.63□□□□□ -1.35
CUX1-220ENST00000607092 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.63□□□□□ -1.35
CUX1-220ENST00000607092 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.63□□□□□ -1.35
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