RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF213	O14771	459 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PCDHGA12	O60330	932 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSPAN1	O60635	241 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AVPR1A	P37288	418 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CYP4F8	P98187	520 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAJC3	Q13217	504 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP2A3	Q93084	1043 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GCNA	Q96QF7	691 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	THSD1	Q9NS62	852 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCL26	Q9Y258	94 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APC	P25054	2843 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1B0GVT2	93 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MARCH6	O60337	910 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MPO	P05164	745 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABRG2	P18507	467 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BRCC3	P46736	316 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ALDH1A3	P47895	512 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ACADVL	P49748	655 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCT8	P50990	548 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OXCT1	P55809	520 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCNA1	Q09470	495 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UGCG	Q16739	394 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CBLL1	Q75N03	491 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MTMR9	Q96QG7	549 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ASB3	Q9Y575	518 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTPRD	P23468	1912 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	E2F8	A0AVK6	867 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM150B	A6NC51	233 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM86B1	E9PN63	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CBX4	O00257	560 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTGES	O14684	152 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LEFTY1	O75610	366 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NPTXR	O95502	500 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CDC25C	P30307	473 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CASR	P41180	1078 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFNAR2	P48551	515 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABRE	P78334	506 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	INF2	Q27J81	1249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIF19	Q2TAC6	998 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	XKR3	Q5GH77	459 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF149	Q8NC42	400 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSMG2	Q969U7	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ISL2	Q96A47	359 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PGBD1	Q96JS3	809 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CEP89	Q96ST8	783 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MMS19	Q96T76	1030 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TDP1	Q9NUW8	608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DKK3	Q9UBP4	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLAA	Q9Y263	795 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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