RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	HCRT	O43612	131 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	DCTN3	O75935	186 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	OVGP1	Q12889	678 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29	9e-8	■■■■■ 29.3
NFE2L1-222	ENST00000585291	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CD101	Q93033	1021 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SP110	Q9HB58	689 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	FBXO21	O94952	628 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	STAMBP	O95630	424 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARFIP2	P53365	341 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	JCHAIN	P01591	159 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	GOT1	P17174	413 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	IL1R2	P27930	398 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	BRCC3	P46736	316 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PCSK7	Q16549	785 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CRCP	O75575	148 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	F9	P00740	461 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	DERA	Q9Y315	318 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	LTF	P02788	710 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SKI	P12755	728 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	RABGGTB	P53611	331 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SESN3	P58005	492 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	LILRA4	P59901	499 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	C2CD2L	O14523	706 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	NOS2	P35228	1153 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	MCU	Q8NE86	351 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SOCS7	O14512	581 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	USP12	O75317	370 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	AVIL	O75366	819 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PMPCB	O75439	489 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	NRL	P54845	237 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CRHR2	Q13324	411 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	WNT8B	Q93098	351 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	RNF103	O00237	685 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	POLB	P06746	335 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLDN10	P78369	228 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	PYGB	P11216	843 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29

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