RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SSTP61278 116 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF7P61962 342 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PPARDQ03181 441 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAP4K2Q12851 820 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM15Q13444 863 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRPC3Q13507 836 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SNX1Q13596 522 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GNA13Q14344 377 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KCNB1Q14721 858 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 STK38Q15208 465 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SNCBQ16143 134 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CRY1Q16526 586 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PRR16Q569H4 304 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD1Q719H9 257 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 STRA8Q7Z7C7 330 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MFN1Q8IWA4 741 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GPR135Q8IZ08 494 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CNTROBQ8N137 903 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OR8H3Q8N146 312 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FAM169BQ8N8A8 192 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DEPTORQ8TB45 409 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 IFI44Q8TCB0 444 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 UCMAQ8WVF2 138 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LPIN2Q92539 896 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 LRGUKQ96M69 825 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WDR24Q96S15 920 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 OR10A2Q9H208 303 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 VPS45Q9NRW7 570 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 VPS18Q9P253 973 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 POLKQ9UBT6 870 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 MYO6Q9UM54 1294 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 NSD2O96028 1365 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FLT1P17948 1338 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ACOD1A6NK06 481 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 AP3D1O14617 1153 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 APOL1O14791 398 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HDAC3O15379 428 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GPR39O43194 453 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ATP8B1O43520 1251 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CBFA2T3O75081 653 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH1A2O94788 518 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ENDOD1O94919 500 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OR5F1O95221 314 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
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