RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	C7orf26	Q96N11	449 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5C1B	Q96P26	610 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HAPLN3	Q96S86	360 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SERINC4	A6NH21	518 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NLC8	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	F2RL2	O00254	374 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM63A	O94886	807 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ARIH2	O95376	493 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRM2	P08172	466 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINF1	P36955	418 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	STAT1	P42224	750 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCD1	P51178	756 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SPARCL1	Q14515	664 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	POSTN	Q15063	836 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MEA1	Q16626	185 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PFKFB4	Q16877	469 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HERVK_113	Q902F9	699 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX19	Q92543	992 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM167A	Q96KS9	214 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB2	Q96Q27	587 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS16	Q9H269	839 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ETAA1	Q9NY74	926 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DACT1	Q9NYF0	836 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR34	Q9UPC5	381 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FSD2	A1L4K1	749 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	POM121B	A6NF01	834 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO1F	O00160	1098 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	APOL1	O14791	398 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NPC1	O15118	1278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SOAT2	O75908	522 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA1	P04083	346 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RHO	P08100	348 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CKMT1A	P12532	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MAL	P21145	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PCSK6	P29122	969 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MPG	P29372	298 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXC13	P31276	330 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP13	P45452	471 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NPTX2	P47972	431 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB1A	P62820	205 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGF	Q07326	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAPC2	Q13487	334 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DCTN1	Q14203	1278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PTK2B	Q14289	1009 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FGL2	Q14314	439 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HECTD3	Q5T447	861 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PDSS2	Q86YH6	399 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	EID2B	Q96D98	161 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VMP1	Q96GC9	406 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SUCLG2	Q96I99	432 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HIC2	Q96JB3	615 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIB1	Q96RU8	372 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms