RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1-218ENST00000557695 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.93□□□□□ -1.62
HECTD1-218ENST00000557695 MIB2Q96AX9 1013 aa4.93□□□□□ -1.62
HECTD1-218ENST00000557695 MEIS3Q99687 375 aa4.93□□□□□ -1.62
HECTD1-218ENST00000557695 TM2D2Q9BX73 214 aa4.93□□□□□ -1.62
HECTD1-218ENST00000557695 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.93□□□□□ -1.62
HECTD1-218ENST00000557695 SELENONQ9NZV5 590 aa4.93□□□□□ -1.62
HECTD1-218ENST00000557695 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
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HECTD1-218ENST00000557695 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.89□□□□□ -1.63
HECTD1-218ENST00000557695 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.89□□□□□ -1.63
HECTD1-218ENST00000557695 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HECTD1-218ENST00000557695 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HECTD1-218ENST00000557695 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.89□□□□□ -1.63
HECTD1-218ENST00000557695 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.89□□□□□ -1.63
HECTD1-218ENST00000557695 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.89□□□□□ -1.63
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