RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 FDPSP14324 419 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PFKLP17858 780 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PTAFRP25105 342 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 LTKP29376 864 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SERPINA4P29622 427 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PRDX5P30044 214 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 MTHFRP42898 656 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ARFIP1P53367 373 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 NRG3P56975 720 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 C21orf58P58505 322 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GMFBP60983 142 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PRAMEP78395 509 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TLE1Q04724 770 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SCN1BQ07699 218 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PTP4A2Q12974 167 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CTBP1Q13363 440 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CAMK2DQ13557 499 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 NFIXQ14938 502 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 INAQ16352 499 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CCDC40Q4G0X9 1142 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 RAB41Q5JT25 222 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TTC22Q5TAA0 569 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 EMC10Q5UCC4 262 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 FAM214BQ7L5A3 538 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 MON1AQ86VX9 555 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 NLRP10Q86W26 655 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SHISA5Q8N114 240 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 MPP5Q8N3R9 675 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CHST13Q8NET6 341 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GPR156Q8NFN8 814 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 NLGN2Q8NFZ4 835 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 LINS1Q8NG48 757 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 FIBINQ8TAL6 211 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CEP76Q8TAP6 659 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TMX3Q96JJ7 454 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 HSPA12BQ96MM6 686 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GCNAQ96QF7 691 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 WDR24Q96S15 920 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 FOXP3Q9BZS1 431 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 VPS16Q9H269 839 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 KAT14Q9H8E8 782 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 POLE3Q9NRF9 147 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GALNT8Q9NY28 637 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 EHD2Q9NZN4 543 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 IL19Q9UHD0 177 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 TCFL5Q9UL49 500 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 AURKCQ9UQB9 309 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 LIPT1Q9Y234 373 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ASB1Q9Y576 335 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PPE2 198 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PQ27 194 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PQ64 194 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PQC6 194 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PQD8 194 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PR64 198 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 GLOD5A6NK44 160 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 LIPT2A6NK58 231 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-232ENST00000552331 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms