RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	SEC13	P55735	322 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	NCAPH	Q15003	741 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	KRT31	Q15323	416 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF276	Q8N554	614 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	MIS12	Q9H081	205 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	VPS16	Q9H269	839 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	HCN2	Q9UL51	889 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC12A8	A0AV02	714 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	EPHB6	O15197	1021 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	LILRB5	O75023	590 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	MBD3	O95983	291 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	FYN	P06241	537 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	FNTB	P49356	437 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PSEN1	P49768	467 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC8A3	P57103	927 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	TYRO3	Q06418	890 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	NR1H3	Q13133	447 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	STIL	Q15468	1287 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	STX1A	Q16623	288 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	ANO4	Q32M45	955 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	EMC10	Q5UCC4	262 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PASD1	Q8IV76	773 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	BHMT	Q93088	406 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	IER2	Q9BTL4	223 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PLK2	Q9NYY3	685 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	PIEZO1	Q92508	2521 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PABPC1-222	ENST00000523555		E5RJQ4	531 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	TULP3	O75386	442 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	ADH1C	P00326	375 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	AMPD2	Q01433	879 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	GAD2	Q05329	585 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	C2orf27A	Q580R0	203 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	DENND1C	Q8IV53	801 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	SCML4	Q8N228	414 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	DCLK2	Q8N568	766 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	USP33	Q8TEY7	942 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	OTUB2	Q96DC9	234 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	HSFY1	Q96LI6	401 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PABPC1-222	ENST00000523555	HHIP	Q96QV1	700 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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