RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 USP29Q9HBJ7 922 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SYNJ1O43426 1573 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 INPPL1O15357 1258 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CD63P08962 238 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ACVR2AP27037 513 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CPT1AP50416 773 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 GPC5P78333 572 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 MMP21Q8N119 569 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FZD4Q9ULV1 537 aa5.79□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CFAP69A5D8W1 941 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 RAB27BO00194 218 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FRS3O43559 492 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 TPH1P17752 444 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 APOA5Q6Q788 366 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 USP49Q70CQ1 688 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 VPS8Q8N3P4 1428 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 NUAK2Q9H093 628 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.78□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SNX2O60749 519 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 INMTO95050 263 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PDGFRBP09619 1106 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 MZT2AQ6P582 158 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 YAF2Q8IY57 180 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 MID2Q9UJV3 735 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.77□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 USP12O75317 370 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 JAK3P52333 1124 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 EPHB1P54762 984 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ANAPC15P60006 121 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 B4GALNT1Q00973 533 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CLCA4Q14CN2 919 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CNGA2Q16280 664 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RUNDC1Q96C34 613 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 NLRP4Q96MN2 994 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 DKK4Q9UBT3 224 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa5.76□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TOP2BQ02880 1626 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF2O60811 474 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PLAUP00749 431 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 T-ENOLP0DO92 83 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RBL1P28749 1068 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 NTSR1P30989 418 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PELI3Q8N2H9 469 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 L1RE1Q9UN81 338 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.75□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CLIP1P30622 1438 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 NOTCH4Q99466 2003 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TMEM225BP0DP42 221 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 IL1R1P14778 569 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CACNB3P54284 484 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 P3H2Q8IVL5 708 aa5.74□□□□□ -1.49
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