RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 PRRT4C9JH25 899 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 TYRP14679 529 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 DUOXA1Q1HG43 343 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 UAP1L1Q3KQV9 507 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 GATA6Q92908 595 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 ADAM33Q9BZ11 813 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP45Q9UL16 551 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 SLC6A14Q9UN76 642 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 HLA-DRAP01903 254 aa31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 MYL1P05976 194 aa31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 SERPINF2P08697 491 aa31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 NFIL3Q16649 462 aa31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 P2RY11Q96G91 374 aa31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 BBS2Q9BXC9 721 aa31.84■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 CYP26A1O43174 497 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF217O75362 1048 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 ENPEPQ07075 957 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA1211LQ6NV74 962 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 CYP3A43Q9HB55 503 aa31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
ALYREF-202ENST00000505490 GFRA2O00451 464 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 NDUFV2P19404 249 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SPINK2P20155 84 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 MAPK8P45983 427 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 KIF11P52732 1056 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF33AQ06730 810 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PKP1Q13835 747 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 RABEPKQ7Z6M1 372 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CYFIP2Q96F07 1278 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SCNM1Q9BWG6 230 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 USP25Q9UHP3 1055 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 HPSEQ9Y251 543 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 USP3Q9Y6I4 520 aa31.82■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM8BA6NDV4 472 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ADORA2BP29275 332 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 WASP42768 502 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G4AP47712 749 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA8FQ08AF8 430 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC186Q7Z3E2 898 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 NT5C1AQ9BXI3 368 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SLC32A1Q9H598 525 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP31.81■■■□□ 2.682e-6■■■■■ 96.1
ALYREF-202ENST00000505490 DNMT3LQ9UJW3 386 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa31.81■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PQH9 124 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CILPO75339 1184 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 RARGP13631 454 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ACO1P21399 889 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PIK3CAP42336 1068 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 VAMP7P51809 220 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 TPGS1Q6ZTW0 290 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SCD5Q86SK9 330 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CHPFQ8IZ52 775 aa31.8■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CLSTN1O94985 981 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CMA1P23946 247 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PSEN1P49768 467 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PPP3CAQ08209 521 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CEP135Q66GS9 1140 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 MRGPRX1Q96LB2 322 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CLIC5Q9NZA1 410 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa31.79■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PKD1L2Q7Z442 2459 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PQD8 194 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CALUO43852 315 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 STC2O76061 302 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PENKP01210 267 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 PFKFB1P16118 471 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 DGKGP49619 791 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 SDE2Q6IQ49 451 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 TAS1R2Q8TE23 839 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 DUSP16Q9BY84 665 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 FSCN3Q9NQT6 498 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa31.78■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 MDM4O15151 490 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 RHOBTB3O94955 611 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 KLKB1P03952 638 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 CFIP05156 583 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ENPP2Q13822 863 aa31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms