RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAGPA	Q9UK23	515 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	16.65	■□□□□ 0.26
PRKCZ-222	ENST00000496325	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAN2B1	O00754	1011 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	THAP12	O43422	761 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP1A3	P13637	1013 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	LCP1	P13796	627 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GNA15	P30679	374 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTH	P32929	405 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLCN1	P35523	988 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFNAR2	P48551	515 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADIG	Q0VDE8	80 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDGFRL	Q15198	375 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NETO1	Q8TDF5	533 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBED1	O96006	694 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	IRF1	P10914	325 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPD2	P43304	727 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NELL2	Q99435	816 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NACA2	Q9H009	215 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ECT2	Q9H8V3	914 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	UCHL3	P15374	230 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTMS	P20962	102 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSEN1	P49768	467 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF165	P49910	485 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PON2	Q15165	354 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF276	Q8N554	614 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAN	Q9H2C0	597 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	E2F8	A0AVK6	867 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325		E7ENQ6	273 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	EPHB6	O15197	1021 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MED7	O43513	233 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPM2	P07951	284 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RALA	P11233	206 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PML	P29590	882 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GJA4	P35212	333 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DAOA	P59103	153 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	IQCB1	Q15051	598 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP2A3	Q93084	1043 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MSANTD3	Q96H12	275 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSFY1	Q96LI6	401 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMTNL1	A8MU46	457 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	LGALS16	A8MUM7	142 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GREM1	O60565	184 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHRNB1	P11230	501 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEA9	P43362	315 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTK2	Q05397	1052 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFEMP1	Q12805	493 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYCP1	Q15431	976 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAB4	Q2WGN9	574 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		16.6	■□□□□ 0.25

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