RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491360.1

ABCB1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 1, human

TSL 2

Gene ABCB1, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB1-208	ENST00000491360	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	ACSL3	O95573	720 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	TTC4	O95801	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	ASGR2	P07307	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PDHA1	P08559	390 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GSTA2	P09210	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	HOXD13	P35453	343 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	VHL	P40337	213 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CCNF	P41002	786 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CTSK	P43235	329 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	NOV	P48745	357 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FMO5	P49326	533 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CASP5	P51878	434 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GPC5	P78333	572 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	MYL7	Q01449	175 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	KRT17	Q04695	432 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	MGAT5	Q09328	741 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CUL3	Q13618	768 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PTK6	Q13882	451 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GIT2	Q14161	759 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	STAT4	Q14765	748 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	UBE2S	Q16763	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	MUM1	Q2TAK8	710 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	AADACL2	Q6P093	401 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SPRED1	Q7Z699	444 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360		Q8N1X5	172 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	BBOF1	Q8ND07	529 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	KRT35	Q92764	455 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	KIFAP3	Q92845	792 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	ZNF333	Q96JL9	665 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	LRRC19	Q9H756	370 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PRR13	Q9NZ81	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	COG5	Q9UP83	839 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	C2CD2	Q9Y426	696 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	ALG6	Q9Y672	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	STRC	Q7RTU9	1775 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	NRAP	Q86VF7	1730 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360		A0A1W2PRG0	241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PDLIM1	O00151	329 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	TBX3	O15119	743 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CLIC2	O15247	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	SORBS3	O60504	671 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	MED24	O75448	989 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GCNT3	O95395	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GAS8	O95995	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	GSN	P06396	782 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	ABHD2	P08910	425 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CREB1	P16220	341 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	COMT	P21964	271 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	KLRK1	P26718	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	MARK3	P27448	753 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	PTPN4	P29074	926 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	FOXN2	P32314	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CHKA	P35790	457 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB1-208	ENST00000491360	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6

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