RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-208ENST00000484454 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.77□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 KIF28PB7ZC32 967 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 H0YIZ8 118 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PDE8BO95263 885 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PRKCBP05771 671 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ALADP13716 330 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 NDUFB7P17568 137 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FPR3P25089 353 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 GRIA3P42263 894 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 GSTM5P46439 218 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 AVPR1BP47901 424 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PSG6Q00889 435 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CSHL1Q14406 222 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ST3GAL2Q16842 350 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PLAC9Q5JTB6 97 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MECRQ9BV79 373 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 DUSP22Q9NRW4 184 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.76□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 A8MVJ9 347 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 B9A039 149 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 M0QYT0 321 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 M0QZQ0 153 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MGST3O14880 152 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 IRAK2O43187 625 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TTLL1O95922 423 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PEPDP12955 493 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 HSD3B1P14060 373 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 KRT4P19013 534 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TNFRSF1AP19438 455 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PAX3P23760 479 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MCM7P33993 719 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MAPK9P45984 424 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CCT5P48643 541 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 POLE2P56282 527 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ARL4CP56559 192 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 SEMA3BQ13214 749 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CUL4BQ13620 913 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 Q8N1X5 172 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 GCC1Q96CN9 775 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 VPS50Q96JG6 964 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 VPS16Q9H269 839 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 RRN3Q9NYV6 651 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 AMFRQ9UKV5 643 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.75□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 KAT6AQ92794 2004 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 H0Y3Z8 333 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 QSOX1O00391 747 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ADRA1DP25100 572 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 DIO1P49895 249 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 CCT8P50990 548 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TAP1Q03518 808 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ABHD18Q0P651 414 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 KCNJ12Q14500 433 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 RPS6KA2Q15349 733 aa4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TARBP1-208ENST00000484454 TRIM60Q495X7 471 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms