RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TUBP50607 506 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TKTL1P51854 596 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RAD23BP54727 409 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 INCA1Q0VD86 236 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CRY1Q16526 586 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 NFIL3Q16649 462 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 GAB4Q2WGN9 574 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PLK5Q496M5 336 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CBWD6Q4V339 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SGO2Q562F6 1265 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PPM1JQ5JR12 505 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PIGZQ86VD9 579 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CHPFQ8IZ52 775 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 NELFBQ8WX92 580 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 OTUB2Q96DC9 234 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SPACA7Q96KW9 195 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 GSDMAQ96QA5 445 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RTKNQ9BST9 563 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ATRXP46100 2492 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 HHLA1C9JL84 531 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TULP2O00295 520 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TSPAN3O60637 253 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 LRP3O75074 770 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 EPN2O95208 641 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CALCAP01258 141 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF806P0C7X5 589 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 HOXB2P14652 356 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TNFRSF4P43489 277 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 DGKGP49619 791 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PSEN1P49768 467 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RGS7P49802 495 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 KIF11P52732 1056 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ARID5AQ03989 594 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ADIGQ0VDE8 80 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CETN1Q12798 172 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CUL2Q13617 745 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CAMK4Q16566 473 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 STPG1Q5TH74 334 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RNF43Q68DV7 783 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM270Q6UE05 265 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RRAGAQ7L523 313 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CACUL1Q86Y37 369 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 DENND1CQ8IV53 801 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TTC39CQ8N584 583 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 FRMD1Q8N878 549 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 DDI1Q8WTU0 396 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RNF139Q8WU17 664 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 EDEM1Q92611 657 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 LOXL4Q96JB6 756 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 NT5C1BQ96P26 610 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ACOX2Q99424 681 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 IL37Q9NZH6 218 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 RAD54BQ9Y620 910 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 PATE3B3GLJ2 98 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 SLC30A4O14863 429 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM23O75077 832 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-209ENST00000480420 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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