RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 UBE3AQ05086 875 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HDXQ7Z353 690 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KRT12Q99456 494 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KLC2Q9H0B6 622 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MTMR11A4FU01 709 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 AP1G2O75843 785 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RNF8O76064 485 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 B3GAT3O94766 335 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 ADIGQ0VDE8 80 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 P3H1Q32P28 736 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 TSGA13Q96PP4 275 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZBP1Q9H171 429 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 KRT1P04264 644 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 ORC1Q13415 861 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 AADACL2Q6P093 401 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TTPALQ9BTX7 342 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 USP29Q9HBJ7 922 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 IRAK2O43187 625 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 GCATO75600 419 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 GJB6O95452 261 aa6.71□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 USP41Q3LFD5 358 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 MON1AQ86VX9 555 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 NUP93Q8N1F7 819 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.71□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 OGFRQ9NZT2 677 aa6.71□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 DRGXA6NNA5 263 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 DEFB106AQ8N104 65 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 SAMD11Q96NU1 681 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM209Q96SK2 561 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 PPCSQ9HAB8 311 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MED4Q9NPJ6 270 aa6.71□□□□□ -1.34
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