RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 PCK1P35558 622 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 BRCC3P46736 316 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PPP3CCP48454 512 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 AIF1P55008 147 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RWDD2BP57060 319 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DSG1Q02413 1049 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PDE4CQ08493 712 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.35□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 MON1AQ86VX9 555 aa7.35□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 CEP57Q86XR8 500 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 XYLT1Q86Y38 959 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 FUKQ8N0W3 1084 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SIX5Q8N196 739 aa7.35□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C12orf29Q8N999 325 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 UBA3Q8TBC4 463 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 HES6Q96HZ4 224 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 FAM84AQ96KN4 292 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA17Q96L03 361 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CNPY3Q9BT09 278 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CARD9Q9H257 536 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 KCNK12Q9HB15 430 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DONSONQ9NYP3 566 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 WNT16Q9UBV4 365 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SNX12Q9UMY4 172 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 DMDP11532 3685 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC188H7C350 402 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PSTPIP1O43586 416 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TBC1D4O60343 1298 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 HSF2BPO75031 334 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 EFEMP2O95967 443 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CTAGE8P0CG41 777 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PDGFRAP16234 1089 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MCM3P25205 808 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 KLRC2P26717 231 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ADORA2BP29275 332 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SDC4P31431 198 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ELF1P32519 619 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 PLD1Q13393 1074 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RAB33AQ14088 237 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MESDQ14696 234 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RAB41Q5JT25 222 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PMF1Q6P1K2 205 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 STRADAQ7RTN6 431 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PIGZQ86VD9 579 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TTC30AQ86WT1 665 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PALB2Q86YC2 1186 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PASD1Q8IV76 773 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.34□□□□□ -1.23
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