RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	GCNT1	Q02742	428 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	LPAL2	Q16609	132 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	MEA1	Q16626	185 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	DEC1	Q9P2X7	70 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	NAGPA	Q9UK23	515 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SGK1	O00141	431 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TM4SF5	O14894	197 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	RHOBTB1	O94844	696 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CLSTN1	O94985	981 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	GNA14	O95837	355 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	KLKB1	P03952	638 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CISD3	P0C7P0	127 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SETSIP	P0DME0	302 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC192	P0DO97	292 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	RALA	P11233	206 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	VDR	P11473	427 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	P2RY2	P41231	377 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF132	P52740	706 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC8A3	P57103	927 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	STIL	Q15468	1287 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF394	Q53GI3	561 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SGO2	Q562F6	1265 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	C2orf27A	Q580R0	203 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	PMS2CL	Q68D20	193 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CPXM2	Q8N436	756 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ALLC	Q8N6M5	410 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TTC16	Q8NEE8	873 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	NACA2	Q9H009	215 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ALDH1A2	O94788	518 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	LATS1	O95835	1130 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ZBED1	O96006	694 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TYR	P14679	529 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CHKA	P35790	457 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	PDE4C	Q08493	712 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ENPP2	Q13822	863 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ELF2	Q15723	593 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CNGA2	Q16280	664 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	FYB2	Q5VWT5	728 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	P2RY11	Q96G91	374 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	GABRG3	Q99928	467 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NPC1	O15118	1278 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NTSR1	P30989	418 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MPL	P40238	635 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TKTL1	P51854	596 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	SEC13	P55735	322 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	EMC10	Q5UCC4	262 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34

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