RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 GPS1Q13098 491 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 XRCC4Q13426 336 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TUSC3Q13454 348 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ITGA7Q13683 1181 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DPYSQ14117 519 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MPP2Q14168 576 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TFDP2Q14188 446 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 PCED1BQ96HM7 432 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SUSD3Q96L08 255 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CAPNS2Q96L46 248 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC114Q96M63 670 aa5.88□□□□□ -1.47
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