RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 SMTNL1A8MU46 457 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 BECN2A8MW95 431 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 E7ENQ6 273 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 EGFP01133 1207 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 Q6ZS52 159 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 IRGQQ8WZA9 623 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 ACP6Q9NPH0 428 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.46■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 CACNA1HO95180 2353 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 RNF40O75150 1001 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 STC2O76061 302 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 LTFP02788 710 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 APODP05090 189 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 GPD2P43304 727 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NRLP54845 237 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SNX16P57768 344 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 KDSRQ06136 332 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 KCNMA1Q12791 1236 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 MEA1Q16626 185 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 TSSK4Q6SA08 328 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PASD1Q8IV76 773 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SCML4Q8N228 414 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PNKPQ96T60 521 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SYNCQ9H7C4 482 aa21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 CAPN9O14815 690 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 UCHL3P15374 230 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SEC13P55735 322 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 UBXN1Q04323 297 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NAT16Q8N8M0 369 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 WBP2Q969T9 261 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PLD4Q96BZ4 506 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PHOX2BQ99453 314 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 BBS2Q9BXC9 721 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.44■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 CHKAP35790 457 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 OPRD1P41143 372 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NBL1P41271 181 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 MRE11P49959 708 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SATB1Q01826 763 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 DENND1CQ8IV53 801 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NEK11Q8NG66 645 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 STK32AQ8WU08 396 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SPAG5Q96R06 1193 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 DEC1Q9P2X7 70 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 R4GN57 208 aa21.43■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 CYBBP04839 570 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 NCAM1P13591 858 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 SLC6A11P48066 632 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF165P49910 485 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 TPM4P67936 248 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM25Q86YD3 366 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 BHMTQ93088 406 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 ACDQ96AP0 544 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 STK33Q9BYT3 514 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.42■■□□□ 1.02
SCAF8-204ENST00000461219 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms