RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443037.1

SOX9-AS1-206, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOX9-AS1, Length 394 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CD58P19256 250 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 COG7P83436 770 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CETN1Q12798 172 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ORC1Q13415 861 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CRY1Q16526 586 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NETO1Q8TDF5 533 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DEC1Q9P2X7 70 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 USP18Q9UMW8 372 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TK2O00142 265 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RHOBTB1O94844 696 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EPN2O95208 641 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GNA14O95837 355 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF806P0C7X5 589 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CCDC192P0DO97 292 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RARGP13631 454 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC6A11P48066 632 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PGFP49763 221 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LIMK1P53667 647 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPEM2Q0P670 501 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CUL2Q13617 745 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CBWD6Q4V339 395 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EOGTQ5NDL2 527 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SCML4Q8N228 414 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TATDN2Q93075 761 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DCLK3Q9C098 648 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 OSER1Q9NX31 292 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.73□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 A0A1W2PQH9 124 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CYP26A1O43174 497 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CACNG3O60359 315 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ALDH1A2O94788 518 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TBX18O95935 607 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CHKAP35790 457 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FMO5P49326 533 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MORC3Q14149 939 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LPAL2Q16609 132 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PLK5Q496M5 336 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C2orf27AQ580R0 203 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 Q6ZNB5 142 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SCD5Q86SK9 330 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HHIPQ96QV1 700 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NMUR1Q9HB89 426 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NAGPAQ9UK23 515 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LAMA1P25391 3075 aa14.72□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC30A4O14863 429 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TULP3O75386 442 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PAEPP09466 180 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 VDRP11473 427 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BCAT1P54687 386 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 E2F5Q15329 346 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 STILQ15468 1287 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ELF2Q15723 593 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF394Q53GI3 561 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SGO2Q562F6 1265 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TTI2Q6NXR4 508 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KBTBD6Q86V97 674 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PIGZQ86VD9 579 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C12orf40Q86WS4 652 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TMEM25Q86YD3 366 aa14.71□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 UBR7Q8N806 425 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms