RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PLK2Q9NYY3 685 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 USP18Q9UMW8 372 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 INVSQ9Y283 1065 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CACNA1AO00555 2505 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 M0QYV0 167 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SGK1O00141 431 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DCLK1O15075 740 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 AXIN1O15169 862 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 P4HA2O15460 535 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GABBR2O75899 941 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ZBED1O96006 694 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KLKB1P03952 638 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LCP1P13796 627 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 HOXA6P31267 233 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PLA2G4AP47712 749 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ID4P47928 161 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PSEN1P49768 467 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SLC8A3P57103 927 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CETN1Q12798 172 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CCDC6Q16204 474 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PKDCCQ504Y2 493 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZNB5 142 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KBTBD6Q86V97 674 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 EDEM1Q92611 657 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 BBS2Q9BXC9 721 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 14.2
PRAME-209ENST00000439106 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CKAP5Q14008 2032 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SLC12A8A0AV02 714 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 E7ENQ6 273 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 APBB3O95704 486 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GNA14O95837 355 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PAEPP09466 180 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TYRP14679 529 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TGM1P22735 817 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CNR2P34972 360 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GRIA2P42262 883 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 WASP42768 502 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DGKEP52429 567 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ANO7Q6IWH7 933 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PMF1Q6P1K2 205 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TERB1Q8NA31 727 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GAB3Q8WWW8 586 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ACP6Q9NPH0 428 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DEC1Q9P2X7 70 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 HCN2Q9UL51 889 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ADAM23O75077 832 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SETSIPP0DME0 302 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 KRT5P13647 590 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 SLC9A1P19634 815 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 ZNF132P52740 706 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GCNT1Q02742 428 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 CRY1Q16526 586 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-209ENST00000439106 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms