RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NR5A2O00482 541 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MSH4O15457 936 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH1A2O94788 518 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB7AO95365 584 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF682O95780 498 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNA14P01570 189 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 JCHAINP01591 159 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTM1P09488 218 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 AVPR1AP37288 418 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP4P49662 377 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MIB1Q86YT6 1006 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KYQ8NBH2 561 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CLPBQ9H078 707 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GPAMQ9HCL2 828 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MGAT4DA6NG13 374 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF862O60290 1169 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NPTXRO95502 500 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NME5P56597 212 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MGAT5Q09328 741 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GRB10Q13322 594 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC4Q5T2S8 1044 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MICALL2Q8IY33 904 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRASP2Q96D09 838 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL9O00512 1426 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BGNP21810 368 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FASP25445 335 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ACOT1Q86TX2 421 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM131BQ86XD5 332 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF614Q8N883 585 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 COPG2Q9UBF2 871 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 UBDO15205 165 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNQ2O43526 872 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BAIAP3O94812 1187 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 HSMCR30P0CW71 290 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT20P35900 424 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RFX3P48380 749 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA2D1P54289 1103 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NR6A1Q15406 480 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SEZ6Q53EL9 994 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GNASQ5JWF2 1037 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCELQ5QJ74 424 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8H2Q8N162 312 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST13Q8NET6 341 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GINS4Q9BRT9 223 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTR8Q9H981 624 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 VTA1Q9NP79 307 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC37A4O43826 429 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MT-CO1P00395 513 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GLI1P08151 1106 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGALP20701 1170 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2B6P20813 491 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GARTP22102 1010 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKDQ16760 1214 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MIER2Q8N344 545 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DPP10Q8N608 796 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BHMTQ93088 406 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CAVIN3Q969G5 261 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM136AQ96C01 138 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms