RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 SLC12A8A0AV02 714 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 E2F8A0AVK6 867 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 YJEFN3A6XGL0 299 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 E7ENQ6 273 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 H0Y858 1186 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 MFAP3LO75121 409 aa10.13□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 FBXO21O94952 628 aa10.13□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.13□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 MSANTD3Q96H12 275 aa10.13□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 E5RJQ4 531 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 F8VZ95 297 aa10.12□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 ADH5P11766 374 aa10.12□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 FMNL3Q8IVF7 1028 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 FAM71AQ8IYT1 594 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 NAT16Q8N8M0 369 aa10.12□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 CD101Q93033 1021 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 WBP2Q969T9 261 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 CHFRQ96EP1 664 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 HSFY1Q96LI6 401 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 P2RY13Q9BPV8 354 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 FAM86C1Q9NVL1 165 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.12□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 STC2O76061 302 aa10.11□□□□□ -0.79
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HERC3-204ENST00000422770 MAGEA9P43362 315 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 SEC13P55735 322 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 GSDMDP57764 484 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 SNX16P57768 344 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 COG7P83436 770 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 DGKKQ5KSL6 1271 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 LY6G5CQ5SRR4 150 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 PM20D1Q6GTS8 502 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 Q6ZS52 159 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-204ENST00000422770 CNGA4Q8IV77 575 aa10.11□□□□□ -0.79
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