RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410983.1

RNU6-564P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 564, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-564P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-564P-201ENST00000410983 VPS50Q96JG6 964 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 MECRQ9BV79 373 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-564P-201ENST00000410983 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 A8MVJ9 347 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 SPDEFO95238 335 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FESP07332 822 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 NR4A1P22736 598 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 KCNJ12Q14500 433 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBCCQ15814 346 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TREML2Q5T2D2 321 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 GPR149Q86SP6 731 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 USP38Q8NB14 1042 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FKBP10Q96AY3 582 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 REEP2Q9BRK0 252 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 BAG5Q9UL15 447 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 MUSKO15146 869 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 PROM1O43490 865 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ONECUT2O95948 504 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM163BP0C2L3 166 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ATP1A3P13637 1013 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 RXRGP48443 463 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 CLCN2P51788 898 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 PDCLQ13371 301 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TP53BP2Q13625 1128 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 VWA1Q6PCB0 445 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 P3H2Q8IVL5 708 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 LNX2Q8N448 690 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TSPYL6Q8N831 410 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 PGBD1Q96JS3 809 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 BDH2Q9BUT1 245 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 CEP72Q9P209 647 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 SCINQ9Y6U3 715 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 STX16O14662 325 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 PMPCBO75439 489 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 RHOP08100 348 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 MMP8P22894 467 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 GKP32189 559 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 THBS4P35443 961 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 NR1H2P55055 460 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 AAK1Q2M2I8 961 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ATG16L1Q676U5 607 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 IL17DQ8TAD2 202 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAR2Q96K12 515 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 ALG8Q9BVK2 526 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 KLC2Q9H0B6 622 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 KLC4Q9NSK0 619 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 EHD3Q9NZN3 535 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-564P-201ENST00000410983 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.7 ms