RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403915.5

KCNS3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-202ENST00000403915 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TSPAN4O14817 238 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SERPINI2O75830 405 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TGDSO95455 350 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 THRAP10827 490 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ANPEPP15144 967 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ADRA2BP18089 450 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 HOXA6P31267 233 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TTKP33981 857 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 KCNJ5P48544 419 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 PDE1AP54750 535 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 AIF1P55008 147 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ITGADQ13349 1161 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 DGKDQ16760 1214 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 UGP2Q16851 508 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 KDELC1Q6UW63 502 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 OR6S1Q8NH40 331 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 FIG4Q92562 907 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 KLC2Q9H0B6 622 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TMEM245Q9H330 911 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 OR51B5Q9H339 312 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 DERAQ9Y315 318 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 PIK3C2BO00750 1634 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 KIF1BO60333 1816 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 POTEB3A0JP26 581 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 LRRC53A6NM62 1247 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TM9SF1O15321 606 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 NDUFA10O95299 355 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 EYA4O95677 639 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 IFNA16P05015 189 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 PGK2P07205 417 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 INHBBP09529 407 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 T-ENOLP0DO92 83 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 CCDC130P13994 396 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 GJC1P36383 396 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TALDO1P37837 337 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 CAPZA2P47755 286 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 RAB14P61106 215 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 COPZ1P61923 177 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 CDR2Q01850 454 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ACVR2BQ13705 512 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 ERV3-1Q14264 604 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 PDIA6Q15084 440 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 POTEBQ6S5H4 581 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 SNX19Q92543 992 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 THAP11Q96EK4 314 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 MROQ9BYG7 248 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNS3-202ENST00000403915 HMX3A6NHT5 357 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 PRRT4C9JH25 899 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 J3QRK9 145 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 TXNDC9O14530 226 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 KRT86O43790 486 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 CDH16O75309 829 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 SCO1O75880 301 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 NPR1P16066 1061 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 TNFAIP3P21580 790 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 SOX6P35712 828 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 BEX3Q00994 111 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 IL1RL1Q01638 556 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 FUT2Q10981 343 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 DLG1Q12959 904 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 VPS72Q15906 364 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 KRT74Q7RTS7 529 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 HPS6Q86YV9 775 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNS3-202ENST00000403915 TPH2Q8IWU9 490 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms